Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EMX2Q04743 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EMX2Q04743 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms