Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms