Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms