Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
XPCQ01831 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
XPCQ01831 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
XPCQ01831 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
XPCQ01831 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
XPCQ01831 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
XPCQ01831 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
XPCQ01831 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
XPCQ01831 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
XPCQ01831 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
XPCQ01831 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
XPCQ01831 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
XPCQ01831 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
XPCQ01831 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
XPCQ01831 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
XPCQ01831 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
XPCQ01831 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
XPCQ01831 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
XPCQ01831 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
XPCQ01831 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
XPCQ01831 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
XPCQ01831 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
XPCQ01831 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
XPCQ01831 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
XPCQ01831 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
XPCQ01831 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
XPCQ01831 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
XPCQ01831 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
XPCQ01831 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
XPCQ01831 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
XPCQ01831 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
XPCQ01831 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
XPCQ01831 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
XPCQ01831 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
XPCQ01831 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
XPCQ01831 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
XPCQ01831 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
XPCQ01831 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
XPCQ01831 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
XPCQ01831 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
XPCQ01831 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
XPCQ01831 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
XPCQ01831 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
XPCQ01831 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
XPCQ01831 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
XPCQ01831 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
XPCQ01831 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
XPCQ01831 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
XPCQ01831 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
XPCQ01831 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
XPCQ01831 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XPCQ01831 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
XPCQ01831 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XPCQ01831 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
XPCQ01831 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
XPCQ01831 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XPCQ01831 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XPCQ01831 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XPCQ01831 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XPCQ01831 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XPCQ01831 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XPCQ01831 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XPCQ01831 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XPCQ01831 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
XPCQ01831 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
XPCQ01831 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
XPCQ01831 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
XPCQ01831 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
XPCQ01831 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
XPCQ01831 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
XPCQ01831 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
XPCQ01831 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
XPCQ01831 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XPCQ01831 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XPCQ01831 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XPCQ01831 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XPCQ01831 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XPCQ01831 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XPCQ01831 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XPCQ01831 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XPCQ01831 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XPCQ01831 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XPCQ01831 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XPCQ01831 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
XPCQ01831 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
XPCQ01831 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XPCQ01831 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XPCQ01831 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
XPCQ01831 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
XPCQ01831 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XPCQ01831 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
XPCQ01831 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
XPCQ01831 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XPCQ01831 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XPCQ01831 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XPCQ01831 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
XPCQ01831 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
XPCQ01831 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
XPCQ01831 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
XPCQ01831 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms