Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
E2F1Q01094 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms