Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms