Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLTCQ00610 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms