Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRX1P78414 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRX1P78414 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRX1P78414 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRX1P78414 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRX1P78414 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRX1P78414 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRX1P78414 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IRX1P78414 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRX1P78414 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRX1P78414 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRX1P78414 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRX1P78414 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRX1P78414 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRX1P78414 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRX1P78414 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRX1P78414 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
IRX1P78414 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRX1P78414 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRX1P78414 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRX1P78414 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRX1P78414 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRX1P78414 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRX1P78414 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRX1P78414 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRX1P78414 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRX1P78414 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRX1P78414 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRX1P78414 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRX1P78414 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRX1P78414 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRX1P78414 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRX1P78414 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRX1P78414 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRX1P78414 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRX1P78414 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRX1P78414 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRX1P78414 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
IRX1P78414 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX1P78414 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX1P78414 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX1P78414 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX1P78414 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX1P78414 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX1P78414 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX1P78414 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX1P78414 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX1P78414 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX1P78414 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX1P78414 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX1P78414 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX1P78414 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX1P78414 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX1P78414 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX1P78414 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX1P78414 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX1P78414 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX1P78414 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX1P78414 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX1P78414 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX1P78414 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX1P78414 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX1P78414 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX1P78414 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX1P78414 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX1P78414 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX1P78414 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX1P78414 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX1P78414 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX1P78414 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX1P78414 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX1P78414 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX1P78414 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX1P78414 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX1P78414 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX1P78414 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX1P78414 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX1P78414 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX1P78414 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX1P78414 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX1P78414 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX1P78414 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX1P78414 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX1P78414 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX1P78414 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX1P78414 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX1P78414 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX1P78414 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX1P78414 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX1P78414 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX1P78414 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
IRX1P78414 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRX1P78414 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRX1P78414 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRX1P78414 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRX1P78414 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRX1P78414 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRX1P78414 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRX1P78414 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRX1P78414 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms