Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms