Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
UBASH3AP57075 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
UBASH3AP57075 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms