Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP9P55211 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP9P55211 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP9P55211 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP9P55211 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP9P55211 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP9P55211 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP9P55211 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP9P55211 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP9P55211 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CASP9P55211 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP9P55211 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP9P55211 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP9P55211 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP9P55211 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP9P55211 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP9P55211 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP9P55211 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP9P55211 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP9P55211 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP9P55211 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP9P55211 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP9P55211 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP9P55211 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP9P55211 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP9P55211 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP9P55211 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP9P55211 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP9P55211 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP9P55211 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP9P55211 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP9P55211 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP9P55211 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP9P55211 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP9P55211 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP9P55211 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP9P55211 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP9P55211 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP9P55211 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP9P55211 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP9P55211 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP9P55211 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP9P55211 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP9P55211 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP9P55211 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP9P55211 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP9P55211 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP9P55211 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP9P55211 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CASP9P55211 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP9P55211 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP9P55211 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP9P55211 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP9P55211 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP9P55211 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP9P55211 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP9P55211 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP9P55211 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP9P55211 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP9P55211 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP9P55211 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP9P55211 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP9P55211 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP9P55211 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP9P55211 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP9P55211 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP9P55211 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP9P55211 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP9P55211 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP9P55211 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP9P55211 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP9P55211 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP9P55211 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP9P55211 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP9P55211 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP9P55211 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP9P55211 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP9P55211 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP9P55211 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP9P55211 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP9P55211 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP9P55211 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP9P55211 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP9P55211 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP9P55211 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP9P55211 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP9P55211 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP9P55211 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP9P55211 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP9P55211 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP9P55211 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CASP9P55211 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CASP9P55211 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CASP9P55211 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CASP9P55211 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CASP9P55211 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CASP9P55211 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CASP9P55211 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CASP9P55211 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CASP9P55211 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms