Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTBP49356 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTBP49356 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTBP49356 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTBP49356 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTBP49356 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTBP49356 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTBP49356 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTBP49356 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTBP49356 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTBP49356 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTBP49356 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTBP49356 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTBP49356 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTBP49356 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTBP49356 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTBP49356 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTBP49356 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTBP49356 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTBP49356 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTBP49356 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTBP49356 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTBP49356 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTBP49356 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTBP49356 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTBP49356 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTBP49356 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTBP49356 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTBP49356 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTBP49356 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTBP49356 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTBP49356 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTBP49356 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTBP49356 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTBP49356 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTBP49356 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTBP49356 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTBP49356 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTBP49356 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTBP49356 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTBP49356 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTBP49356 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTBP49356 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTBP49356 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTBP49356 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTBP49356 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTBP49356 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTBP49356 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTBP49356 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTBP49356 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTBP49356 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTBP49356 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTBP49356 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTBP49356 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTBP49356 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTBP49356 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTBP49356 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTBP49356 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTBP49356 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTBP49356 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTBP49356 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTBP49356 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTBP49356 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTBP49356 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTBP49356 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTBP49356 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTBP49356 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTBP49356 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTBP49356 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTBP49356 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTBP49356 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTBP49356 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTBP49356 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTBP49356 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTBP49356 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTBP49356 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTBP49356 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTBP49356 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FNTBP49356 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FNTBP49356 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FNTBP49356 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FNTBP49356 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FNTBP49356 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FNTBP49356 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FNTBP49356 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FNTBP49356 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNTBP49356 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNTBP49356 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNTBP49356 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNTBP49356 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNTBP49356 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNTBP49356 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNTBP49356 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNTBP49356 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNTBP49356 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNTBP49356 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNTBP49356 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FNTBP49356 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FNTBP49356 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNTBP49356 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms