Protein–RNA interactions for Protein: P41162

ETV3, ETS translocation variant 3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV3P41162 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV3P41162 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV3P41162 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV3P41162 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV3P41162 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV3P41162 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV3P41162 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV3P41162 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV3P41162 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV3P41162 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV3P41162 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV3P41162 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV3P41162 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV3P41162 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV3P41162 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV3P41162 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV3P41162 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV3P41162 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV3P41162 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV3P41162 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV3P41162 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV3P41162 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV3P41162 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV3P41162 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV3P41162 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV3P41162 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV3P41162 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETV3P41162 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ETV3P41162 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ETV3P41162 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ETV3P41162 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ETV3P41162 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ETV3P41162 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ETV3P41162 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ETV3P41162 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ETV3P41162 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ETV3P41162 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ETV3P41162 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ETV3P41162 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ETV3P41162 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ETV3P41162 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ETV3P41162 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ETV3P41162 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ETV3P41162 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV3P41162 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV3P41162 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV3P41162 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV3P41162 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV3P41162 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV3P41162 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV3P41162 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV3P41162 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV3P41162 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV3P41162 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV3P41162 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV3P41162 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV3P41162 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV3P41162 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV3P41162 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV3P41162 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV3P41162 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV3P41162 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV3P41162 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV3P41162 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV3P41162 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV3P41162 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV3P41162 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV3P41162 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV3P41162 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV3P41162 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV3P41162 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV3P41162 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV3P41162 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV3P41162 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV3P41162 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV3P41162 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV3P41162 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETV3P41162 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETV3P41162 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETV3P41162 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETV3P41162 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETV3P41162 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETV3P41162 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETV3P41162 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETV3P41162 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETV3P41162 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETV3P41162 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETV3P41162 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETV3P41162 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETV3P41162 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETV3P41162 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETV3P41162 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETV3P41162 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETV3P41162 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETV3P41162 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ETV3P41162 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETV3P41162 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETV3P41162 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ETV3P41162 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ETV3P41162 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms