Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL1P40616 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL1P40616 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL1P40616 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL1P40616 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL1P40616 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL1P40616 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL1P40616 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL1P40616 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL1P40616 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL1P40616 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL1P40616 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL1P40616 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL1P40616 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL1P40616 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL1P40616 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL1P40616 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL1P40616 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL1P40616 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL1P40616 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL1P40616 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL1P40616 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARL1P40616 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL1P40616 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL1P40616 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL1P40616 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL1P40616 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL1P40616 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL1P40616 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL1P40616 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL1P40616 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL1P40616 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL1P40616 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL1P40616 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL1P40616 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL1P40616 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL1P40616 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL1P40616 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL1P40616 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL1P40616 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL1P40616 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL1P40616 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL1P40616 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL1P40616 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL1P40616 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL1P40616 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL1P40616 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL1P40616 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL1P40616 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL1P40616 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL1P40616 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL1P40616 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL1P40616 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL1P40616 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL1P40616 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL1P40616 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL1P40616 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL1P40616 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL1P40616 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL1P40616 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL1P40616 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL1P40616 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARL1P40616 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARL1P40616 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARL1P40616 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARL1P40616 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARL1P40616 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARL1P40616 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARL1P40616 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARL1P40616 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARL1P40616 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARL1P40616 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARL1P40616 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARL1P40616 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARL1P40616 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARL1P40616 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARL1P40616 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARL1P40616 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARL1P40616 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ARL1P40616 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARL1P40616 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ARL1P40616 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARL1P40616 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARL1P40616 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARL1P40616 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARL1P40616 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARL1P40616 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARL1P40616 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARL1P40616 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARL1P40616 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARL1P40616 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARL1P40616 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARL1P40616 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARL1P40616 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARL1P40616 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARL1P40616 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARL1P40616 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARL1P40616 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARL1P40616 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARL1P40616 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms