Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ITGAEP38570 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGAEP38570 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms