Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GGCXP38435 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GGCXP38435 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GGCXP38435 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GGCXP38435 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GGCXP38435 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GGCXP38435 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GGCXP38435 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GGCXP38435 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GGCXP38435 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GGCXP38435 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GGCXP38435 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GGCXP38435 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GGCXP38435 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GGCXP38435 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GGCXP38435 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GGCXP38435 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GGCXP38435 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GGCXP38435 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GGCXP38435 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GGCXP38435 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GGCXP38435 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GGCXP38435 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GGCXP38435 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GGCXP38435 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GGCXP38435 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GGCXP38435 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GGCXP38435 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GGCXP38435 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GGCXP38435 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GGCXP38435 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GGCXP38435 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GGCXP38435 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GGCXP38435 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GGCXP38435 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GGCXP38435 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GGCXP38435 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GGCXP38435 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GGCXP38435 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GGCXP38435 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GGCXP38435 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GGCXP38435 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GGCXP38435 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GGCXP38435 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GGCXP38435 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GGCXP38435 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GGCXP38435 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GGCXP38435 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GGCXP38435 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GGCXP38435 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GGCXP38435 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GGCXP38435 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GGCXP38435 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GGCXP38435 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GGCXP38435 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GGCXP38435 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GGCXP38435 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GGCXP38435 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GGCXP38435 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GGCXP38435 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GGCXP38435 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GGCXP38435 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GGCXP38435 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GGCXP38435 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GGCXP38435 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GGCXP38435 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GGCXP38435 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GGCXP38435 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GGCXP38435 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GGCXP38435 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GGCXP38435 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GGCXP38435 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GGCXP38435 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GGCXP38435 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GGCXP38435 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GGCXP38435 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GGCXP38435 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GGCXP38435 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GGCXP38435 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GGCXP38435 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GGCXP38435 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GGCXP38435 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GGCXP38435 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GGCXP38435 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GGCXP38435 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GGCXP38435 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GGCXP38435 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GGCXP38435 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GGCXP38435 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GGCXP38435 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GGCXP38435 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GGCXP38435 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GGCXP38435 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GGCXP38435 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GGCXP38435 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GGCXP38435 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GGCXP38435 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GGCXP38435 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GGCXP38435 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GGCXP38435 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms