Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBRP36941 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBRP36941 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBRP36941 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBRP36941 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBRP36941 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBRP36941 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBRP36941 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBRP36941 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBRP36941 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBRP36941 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBRP36941 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBRP36941 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBRP36941 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBRP36941 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBRP36941 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBRP36941 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBRP36941 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBRP36941 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBRP36941 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBRP36941 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBRP36941 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LTBRP36941 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBRP36941 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBRP36941 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBRP36941 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBRP36941 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBRP36941 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBRP36941 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBRP36941 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBRP36941 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBRP36941 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBRP36941 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBRP36941 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBRP36941 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBRP36941 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBRP36941 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBRP36941 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBRP36941 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBRP36941 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBRP36941 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBRP36941 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBRP36941 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBRP36941 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBRP36941 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBRP36941 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBRP36941 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBRP36941 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LTBRP36941 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTBRP36941 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTBRP36941 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTBRP36941 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTBRP36941 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTBRP36941 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTBRP36941 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTBRP36941 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTBRP36941 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTBRP36941 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTBRP36941 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTBRP36941 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTBRP36941 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTBRP36941 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTBRP36941 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTBRP36941 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LTBRP36941 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LTBRP36941 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTBRP36941 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTBRP36941 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTBRP36941 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTBRP36941 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTBRP36941 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LTBRP36941 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTBRP36941 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTBRP36941 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTBRP36941 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTBRP36941 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTBRP36941 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTBRP36941 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTBRP36941 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTBRP36941 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LTBRP36941 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LTBRP36941 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBRP36941 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBRP36941 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBRP36941 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBRP36941 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBRP36941 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBRP36941 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBRP36941 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBRP36941 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBRP36941 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBRP36941 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBRP36941 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBRP36941 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBRP36941 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBRP36941 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBRP36941 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBRP36941 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBRP36941 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LTBRP36941 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms