Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms