Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC1P35052 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC1P35052 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC1P35052 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC1P35052 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC1P35052 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC1P35052 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC1P35052 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC1P35052 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC1P35052 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC1P35052 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC1P35052 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC1P35052 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC1P35052 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC1P35052 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC1P35052 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC1P35052 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC1P35052 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC1P35052 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC1P35052 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC1P35052 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC1P35052 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC1P35052 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC1P35052 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC1P35052 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC1P35052 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC1P35052 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC1P35052 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC1P35052 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC1P35052 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC1P35052 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC1P35052 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC1P35052 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC1P35052 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC1P35052 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC1P35052 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC1P35052 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC1P35052 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC1P35052 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC1P35052 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC1P35052 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC1P35052 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC1P35052 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC1P35052 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC1P35052 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC1P35052 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC1P35052 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC1P35052 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC1P35052 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC1P35052 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC1P35052 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC1P35052 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC1P35052 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC1P35052 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC1P35052 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC1P35052 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC1P35052 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC1P35052 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC1P35052 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC1P35052 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC1P35052 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC1P35052 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC1P35052 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC1P35052 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC1P35052 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC1P35052 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC1P35052 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC1P35052 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC1P35052 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC1P35052 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC1P35052 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC1P35052 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC1P35052 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC1P35052 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC1P35052 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC1P35052 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC1P35052 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC1P35052 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC1P35052 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC1P35052 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC1P35052 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC1P35052 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC1P35052 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC1P35052 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC1P35052 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC1P35052 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC1P35052 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC1P35052 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC1P35052 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC1P35052 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC1P35052 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC1P35052 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC1P35052 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC1P35052 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC1P35052 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC1P35052 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC1P35052 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC1P35052 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC1P35052 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC1P35052 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms