Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASQ1P31415 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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