Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP1P29466 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP1P29466 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP1P29466 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP1P29466 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP1P29466 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP1P29466 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP1P29466 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP1P29466 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP1P29466 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP1P29466 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP1P29466 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP1P29466 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP1P29466 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP1P29466 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP1P29466 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP1P29466 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP1P29466 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP1P29466 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP1P29466 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP1P29466 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP1P29466 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP1P29466 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP1P29466 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP1P29466 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP1P29466 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP1P29466 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP1P29466 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP1P29466 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP1P29466 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP1P29466 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP1P29466 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP1P29466 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP1P29466 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP1P29466 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP1P29466 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP1P29466 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP1P29466 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP1P29466 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP1P29466 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP1P29466 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP1P29466 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP1P29466 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP1P29466 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP1P29466 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP1P29466 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP1P29466 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP1P29466 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP1P29466 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP1P29466 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP1P29466 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP1P29466 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP1P29466 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP1P29466 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP1P29466 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP1P29466 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP1P29466 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP1P29466 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP1P29466 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP1P29466 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP1P29466 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP1P29466 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP1P29466 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP1P29466 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP1P29466 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP1P29466 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP1P29466 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP1P29466 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP1P29466 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP1P29466 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP1P29466 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP1P29466 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP1P29466 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP1P29466 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP1P29466 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP1P29466 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP1P29466 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP1P29466 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP1P29466 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP1P29466 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP1P29466 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP1P29466 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP1P29466 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP1P29466 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP1P29466 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP1P29466 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP1P29466 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP1P29466 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP1P29466 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP1P29466 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP1P29466 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP1P29466 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP1P29466 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP1P29466 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP1P29466 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP1P29466 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP1P29466 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP1P29466 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP1P29466 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CASP1P29466 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms