Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms