Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB4P28070 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms