Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LMO1P25800 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LMO1P25800 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LMO1P25800 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LMO1P25800 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LMO1P25800 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LMO1P25800 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LMO1P25800 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
LMO1P25800 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LMO1P25800 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
LMO1P25800 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
LMO1P25800 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
LMO1P25800 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LMO1P25800 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LMO1P25800 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LMO1P25800 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LMO1P25800 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
LMO1P25800 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LMO1P25800 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LMO1P25800 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
LMO1P25800 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LMO1P25800 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
LMO1P25800 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LMO1P25800 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LMO1P25800 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LMO1P25800 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LMO1P25800 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
LMO1P25800 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
LMO1P25800 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO1P25800 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO1P25800 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO1P25800 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO1P25800 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO1P25800 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO1P25800 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO1P25800 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO1P25800 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO1P25800 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO1P25800 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO1P25800 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO1P25800 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO1P25800 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO1P25800 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO1P25800 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO1P25800 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO1P25800 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO1P25800 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO1P25800 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO1P25800 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO1P25800 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO1P25800 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO1P25800 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO1P25800 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO1P25800 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO1P25800 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO1P25800 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO1P25800 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO1P25800 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO1P25800 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO1P25800 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO1P25800 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO1P25800 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO1P25800 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO1P25800 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO1P25800 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO1P25800 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO1P25800 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO1P25800 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO1P25800 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO1P25800 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO1P25800 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO1P25800 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO1P25800 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO1P25800 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO1P25800 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO1P25800 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO1P25800 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO1P25800 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO1P25800 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO1P25800 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO1P25800 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO1P25800 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO1P25800 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO1P25800 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO1P25800 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO1P25800 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
LMO1P25800 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LMO1P25800 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
LMO1P25800 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
LMO1P25800 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LMO1P25800 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LMO1P25800 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
LMO1P25800 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
LMO1P25800 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO1P25800 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO1P25800 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO1P25800 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO1P25800 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO1P25800 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
LMO1P25800 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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