Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
APCP25054 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
APCP25054 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
APCP25054 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
APCP25054 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
APCP25054 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
APCP25054 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
APCP25054 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
APCP25054 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
APCP25054 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
APCP25054 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
APCP25054 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
APCP25054 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
APCP25054 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
APCP25054 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
APCP25054 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
APCP25054 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
APCP25054 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
APCP25054 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
APCP25054 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
APCP25054 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
APCP25054 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
APCP25054 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
APCP25054 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
APCP25054 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
APCP25054 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
APCP25054 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
APCP25054 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
APCP25054 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
APCP25054 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
APCP25054 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
APCP25054 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
APCP25054 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
APCP25054 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
APCP25054 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
APCP25054 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
APCP25054 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
APCP25054 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
APCP25054 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
APCP25054 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
APCP25054 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
APCP25054 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
APCP25054 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
APCP25054 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
APCP25054 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
APCP25054 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
APCP25054 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
APCP25054 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
APCP25054 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
APCP25054 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
APCP25054 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
APCP25054 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
APCP25054 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
APCP25054 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
APCP25054 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
APCP25054 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
APCP25054 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
APCP25054 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
APCP25054 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
APCP25054 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
APCP25054 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
APCP25054 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
APCP25054 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
APCP25054 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
APCP25054 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
APCP25054 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
APCP25054 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
APCP25054 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
APCP25054 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
APCP25054 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
APCP25054 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
APCP25054 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
APCP25054 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
APCP25054 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
APCP25054 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
APCP25054 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
APCP25054 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
APCP25054 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
APCP25054 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
APCP25054 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
APCP25054 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
APCP25054 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
APCP25054 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
APCP25054 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
APCP25054 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
APCP25054 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
APCP25054 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
APCP25054 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
APCP25054 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
APCP25054 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
APCP25054 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
APCP25054 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
APCP25054 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
APCP25054 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
APCP25054 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
APCP25054 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
APCP25054 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
APCP25054 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
APCP25054 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
APCP25054 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms