Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRDP23468 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
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