Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FGFR3P22607 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FGFR3P22607 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGFR3P22607 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FGFR3P22607 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGFR3P22607 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGFR3P22607 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FGFR3P22607 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGFR3P22607 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGFR3P22607 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGFR3P22607 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGFR3P22607 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGFR3P22607 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGFR3P22607 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGFR3P22607 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGFR3P22607 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGFR3P22607 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGFR3P22607 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGFR3P22607 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FGFR3P22607 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms