Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD247P20963 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD247P20963 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD247P20963 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD247P20963 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD247P20963 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD247P20963 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD247P20963 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD247P20963 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CD247P20963 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD247P20963 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD247P20963 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD247P20963 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD247P20963 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD247P20963 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD247P20963 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD247P20963 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD247P20963 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CD247P20963 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD247P20963 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD247P20963 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD247P20963 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD247P20963 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD247P20963 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CD247P20963 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CD247P20963 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD247P20963 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD247P20963 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD247P20963 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD247P20963 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD247P20963 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD247P20963 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD247P20963 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD247P20963 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD247P20963 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD247P20963 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD247P20963 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD247P20963 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD247P20963 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD247P20963 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD247P20963 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD247P20963 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD247P20963 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD247P20963 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD247P20963 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CD247P20963 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD247P20963 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD247P20963 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD247P20963 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD247P20963 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD247P20963 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CD247P20963 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD247P20963 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD247P20963 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD247P20963 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD247P20963 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD247P20963 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CD247P20963 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD247P20963 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD247P20963 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD247P20963 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD247P20963 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD247P20963 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD247P20963 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD247P20963 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD247P20963 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD247P20963 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD247P20963 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD247P20963 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD247P20963 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD247P20963 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD247P20963 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD247P20963 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD247P20963 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD247P20963 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD247P20963 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD247P20963 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD247P20963 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD247P20963 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD247P20963 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD247P20963 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD247P20963 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD247P20963 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD247P20963 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD247P20963 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD247P20963 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD247P20963 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD247P20963 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD247P20963 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD247P20963 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD247P20963 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD247P20963 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD247P20963 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD247P20963 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD247P20963 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD247P20963 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD247P20963 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD247P20963 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CD247P20963 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CD247P20963 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms