Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNA1P20827 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms