Protein–RNA interactions for Protein: P20333

TNFRSF1B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF1BP20333 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TNFRSF1BP20333 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms