Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPI1P17947 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPI1P17947 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPI1P17947 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPI1P17947 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPI1P17947 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPI1P17947 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPI1P17947 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPI1P17947 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPI1P17947 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPI1P17947 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPI1P17947 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPI1P17947 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPI1P17947 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPI1P17947 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPI1P17947 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPI1P17947 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPI1P17947 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPI1P17947 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPI1P17947 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPI1P17947 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPI1P17947 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPI1P17947 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPI1P17947 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPI1P17947 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPI1P17947 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPI1P17947 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPI1P17947 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SPI1P17947 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SPI1P17947 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SPI1P17947 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPI1P17947 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPI1P17947 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPI1P17947 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SPI1P17947 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPI1P17947 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPI1P17947 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPI1P17947 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SPI1P17947 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPI1P17947 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPI1P17947 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPI1P17947 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPI1P17947 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPI1P17947 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPI1P17947 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPI1P17947 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPI1P17947 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SPI1P17947 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPI1P17947 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPI1P17947 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPI1P17947 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPI1P17947 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPI1P17947 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPI1P17947 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPI1P17947 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPI1P17947 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPI1P17947 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPI1P17947 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPI1P17947 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPI1P17947 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPI1P17947 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPI1P17947 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPI1P17947 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPI1P17947 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPI1P17947 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SPI1P17947 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPI1P17947 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SPI1P17947 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPI1P17947 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPI1P17947 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPI1P17947 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPI1P17947 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPI1P17947 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPI1P17947 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPI1P17947 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPI1P17947 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPI1P17947 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPI1P17947 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPI1P17947 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPI1P17947 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPI1P17947 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPI1P17947 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPI1P17947 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPI1P17947 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPI1P17947 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPI1P17947 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPI1P17947 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPI1P17947 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPI1P17947 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPI1P17947 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPI1P17947 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPI1P17947 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPI1P17947 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPI1P17947 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPI1P17947 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SPI1P17947 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPI1P17947 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPI1P17947 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPI1P17947 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SPI1P17947 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms