Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRF1P14222 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRF1P14222 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRF1P14222 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRF1P14222 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRF1P14222 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRF1P14222 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRF1P14222 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRF1P14222 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRF1P14222 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRF1P14222 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRF1P14222 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PRF1P14222 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRF1P14222 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRF1P14222 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRF1P14222 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRF1P14222 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PRF1P14222 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRF1P14222 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRF1P14222 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRF1P14222 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRF1P14222 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRF1P14222 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRF1P14222 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRF1P14222 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PRF1P14222 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRF1P14222 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PRF1P14222 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PRF1P14222 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRF1P14222 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRF1P14222 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRF1P14222 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRF1P14222 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRF1P14222 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRF1P14222 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRF1P14222 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRF1P14222 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRF1P14222 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRF1P14222 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRF1P14222 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRF1P14222 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRF1P14222 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRF1P14222 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRF1P14222 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRF1P14222 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRF1P14222 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PRF1P14222 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PRF1P14222 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PRF1P14222 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PRF1P14222 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PRF1P14222 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PRF1P14222 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PRF1P14222 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PRF1P14222 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PRF1P14222 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PRF1P14222 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PRF1P14222 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRF1P14222 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRF1P14222 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRF1P14222 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRF1P14222 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PRF1P14222 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRF1P14222 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PRF1P14222 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRF1P14222 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRF1P14222 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRF1P14222 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRF1P14222 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRF1P14222 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRF1P14222 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRF1P14222 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRF1P14222 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRF1P14222 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRF1P14222 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRF1P14222 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRF1P14222 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PRF1P14222 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PRF1P14222 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRF1P14222 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRF1P14222 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PRF1P14222 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRF1P14222 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRF1P14222 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRF1P14222 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRF1P14222 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRF1P14222 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRF1P14222 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRF1P14222 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRF1P14222 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRF1P14222 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRF1P14222 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PRF1P14222 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRF1P14222 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRF1P14222 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRF1P14222 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRF1P14222 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRF1P14222 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRF1P14222 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRF1P14222 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRF1P14222 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms