Protein–RNA interactions for Protein: P13804

ETFA, Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFAP13804 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFAP13804 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFAP13804 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFAP13804 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFAP13804 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFAP13804 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFAP13804 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFAP13804 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFAP13804 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFAP13804 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFAP13804 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFAP13804 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFAP13804 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFAP13804 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFAP13804 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFAP13804 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFAP13804 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFAP13804 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFAP13804 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFAP13804 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFAP13804 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFAP13804 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFAP13804 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFAP13804 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFAP13804 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFAP13804 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFAP13804 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFAP13804 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFAP13804 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFAP13804 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFAP13804 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFAP13804 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFAP13804 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFAP13804 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFAP13804 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFAP13804 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFAP13804 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFAP13804 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFAP13804 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFAP13804 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFAP13804 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFAP13804 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFAP13804 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFAP13804 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFAP13804 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFAP13804 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ETFAP13804 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFAP13804 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFAP13804 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFAP13804 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFAP13804 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFAP13804 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFAP13804 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFAP13804 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFAP13804 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFAP13804 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFAP13804 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFAP13804 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFAP13804 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFAP13804 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFAP13804 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFAP13804 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFAP13804 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFAP13804 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFAP13804 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFAP13804 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFAP13804 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFAP13804 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFAP13804 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFAP13804 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFAP13804 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFAP13804 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFAP13804 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFAP13804 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFAP13804 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFAP13804 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFAP13804 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFAP13804 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFAP13804 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFAP13804 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFAP13804 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFAP13804 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFAP13804 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFAP13804 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFAP13804 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFAP13804 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFAP13804 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFAP13804 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFAP13804 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFAP13804 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFAP13804 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFAP13804 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFAP13804 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFAP13804 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFAP13804 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFAP13804 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFAP13804 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFAP13804 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFAP13804 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ETFAP13804 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms