Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CFTRP13569 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CFTRP13569 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFTRP13569 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CFTRP13569 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFTRP13569 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CFTRP13569 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFTRP13569 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFTRP13569 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFTRP13569 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFTRP13569 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFTRP13569 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFTRP13569 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CFTRP13569 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CFTRP13569 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFTRP13569 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFTRP13569 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFTRP13569 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CFTRP13569 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CFTRP13569 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFTRP13569 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFTRP13569 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFTRP13569 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFTRP13569 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFTRP13569 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFTRP13569 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFTRP13569 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CFTRP13569 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CFTRP13569 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CFTRP13569 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CFTRP13569 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CFTRP13569 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CFTRP13569 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CFTRP13569 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CFTRP13569 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CFTRP13569 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CFTRP13569 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CFTRP13569 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CFTRP13569 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CFTRP13569 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CFTRP13569 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CFTRP13569 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CFTRP13569 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CFTRP13569 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CFTRP13569 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CFTRP13569 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CFTRP13569 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFTRP13569 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFTRP13569 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFTRP13569 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFTRP13569 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFTRP13569 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFTRP13569 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFTRP13569 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFTRP13569 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFTRP13569 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFTRP13569 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFTRP13569 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFTRP13569 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
CFTRP13569 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CFTRP13569 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CFTRP13569 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CFTRP13569 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CFTRP13569 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CFTRP13569 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CFTRP13569 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CFTRP13569 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CFTRP13569 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CFTRP13569 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CFTRP13569 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CFTRP13569 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CFTRP13569 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CFTRP13569 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CFTRP13569 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CFTRP13569 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CFTRP13569 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CFTRP13569 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CFTRP13569 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CFTRP13569 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CFTRP13569 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CFTRP13569 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CFTRP13569 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CFTRP13569 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CFTRP13569 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CFTRP13569 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CFTRP13569 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CFTRP13569 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CFTRP13569 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CFTRP13569 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CFTRP13569 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CFTRP13569 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CFTRP13569 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CFTRP13569 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CFTRP13569 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CFTRP13569 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CFTRP13569 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CFTRP13569 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CFTRP13569 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CFTRP13569 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CFTRP13569 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms