Protein–RNA interactions for Protein: P13073

COX4I1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I1P13073 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms