Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C8orf88P0DMB2 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms