Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOP08100 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOP08100 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOP08100 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOP08100 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOP08100 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOP08100 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOP08100 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOP08100 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOP08100 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOP08100 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOP08100 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOP08100 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOP08100 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOP08100 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOP08100 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOP08100 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOP08100 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOP08100 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOP08100 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOP08100 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOP08100 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOP08100 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOP08100 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOP08100 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOP08100 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOP08100 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOP08100 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOP08100 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOP08100 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOP08100 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOP08100 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOP08100 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOP08100 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOP08100 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOP08100 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RHOP08100 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHOP08100 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHOP08100 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHOP08100 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RHOP08100 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHOP08100 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHOP08100 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHOP08100 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHOP08100 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHOP08100 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHOP08100 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHOP08100 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHOP08100 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHOP08100 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHOP08100 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHOP08100 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHOP08100 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHOP08100 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHOP08100 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHOP08100 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHOP08100 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RHOP08100 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHOP08100 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHOP08100 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RHOP08100 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHOP08100 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RHOP08100 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHOP08100 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHOP08100 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHOP08100 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHOP08100 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHOP08100 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHOP08100 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RHOP08100 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RHOP08100 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHOP08100 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHOP08100 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHOP08100 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHOP08100 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHOP08100 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHOP08100 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHOP08100 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHOP08100 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHOP08100 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHOP08100 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHOP08100 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RHOP08100 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHOP08100 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHOP08100 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHOP08100 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHOP08100 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHOP08100 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHOP08100 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHOP08100 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHOP08100 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHOP08100 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHOP08100 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHOP08100 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHOP08100 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RHOP08100 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHOP08100 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHOP08100 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHOP08100 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RHOP08100 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms