Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSLP07711 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSLP07711 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSLP07711 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSLP07711 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSLP07711 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSLP07711 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSLP07711 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CTSLP07711 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTSLP07711 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTSLP07711 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTSLP07711 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTSLP07711 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTSLP07711 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTSLP07711 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTSLP07711 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTSLP07711 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CTSLP07711 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSLP07711 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSLP07711 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSLP07711 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSLP07711 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSLP07711 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSLP07711 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSLP07711 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSLP07711 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSLP07711 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSLP07711 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSLP07711 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSLP07711 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSLP07711 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSLP07711 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSLP07711 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSLP07711 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSLP07711 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSLP07711 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSLP07711 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSLP07711 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSLP07711 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSLP07711 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSLP07711 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSLP07711 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSLP07711 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSLP07711 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSLP07711 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSLP07711 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSLP07711 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSLP07711 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSLP07711 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSLP07711 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSLP07711 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSLP07711 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSLP07711 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSLP07711 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSLP07711 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSLP07711 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSLP07711 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSLP07711 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSLP07711 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSLP07711 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSLP07711 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSLP07711 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSLP07711 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSLP07711 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSLP07711 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSLP07711 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSLP07711 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTSLP07711 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSLP07711 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSLP07711 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSLP07711 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSLP07711 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSLP07711 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSLP07711 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSLP07711 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSLP07711 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSLP07711 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSLP07711 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSLP07711 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSLP07711 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSLP07711 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSLP07711 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSLP07711 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSLP07711 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSLP07711 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSLP07711 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSLP07711 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSLP07711 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSLP07711 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSLP07711 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSLP07711 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSLP07711 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSLP07711 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSLP07711 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSLP07711 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSLP07711 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSLP07711 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSLP07711 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSLP07711 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTSLP07711 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms