Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR1AO95602 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR1AO95602 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms