Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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