Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNSO60931 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNSO60931 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNSO60931 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNSO60931 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNSO60931 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNSO60931 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNSO60931 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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CTNSO60931 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CTNSO60931 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNSO60931 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNSO60931 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNSO60931 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNSO60931 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNSO60931 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNSO60931 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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CTNSO60931 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNSO60931 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNSO60931 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNSO60931 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNSO60931 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNSO60931 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNSO60931 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNSO60931 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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CTNSO60931 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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CTNSO60931 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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CTNSO60931 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNSO60931 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNSO60931 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNSO60931 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNSO60931 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNSO60931 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNSO60931 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNSO60931 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CTNSO60931 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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CTNSO60931 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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CTNSO60931 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNSO60931 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNSO60931 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNSO60931 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNSO60931 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CTNSO60931 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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