Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PDE6DO43924 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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PDE6DO43924 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
PDE6DO43924 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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PDE6DO43924 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PDE6DO43924 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PDE6DO43924 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PDE6DO43924 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PDE6DO43924 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PDE6DO43924 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PDE6DO43924 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PDE6DO43924 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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