Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFS4O43181 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms