Protein–RNA interactions for Protein: O15230

LAMA5, Laminin subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 3,695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5O15230 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LAMA5O15230 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms