Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TO15178 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TO15178 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TO15178 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TO15178 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TO15178 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TO15178 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TO15178 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TO15178 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TO15178 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TO15178 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TO15178 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TO15178 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TO15178 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TO15178 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TO15178 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TO15178 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TO15178 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TO15178 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TO15178 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TO15178 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TO15178 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TO15178 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TO15178 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TO15178 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TO15178 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TO15178 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TO15178 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TO15178 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TO15178 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TO15178 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TO15178 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TO15178 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TO15178 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TO15178 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TO15178 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TO15178 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TO15178 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TO15178 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TO15178 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TO15178 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TO15178 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TO15178 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TO15178 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TO15178 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TO15178 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TO15178 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TO15178 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TO15178 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TO15178 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TO15178 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TO15178 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TO15178 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TO15178 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TO15178 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TO15178 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TO15178 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TO15178 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TO15178 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TO15178 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TO15178 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TO15178 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TO15178 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TO15178 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TO15178 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TO15178 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TO15178 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TO15178 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TO15178 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TO15178 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TO15178 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TO15178 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TO15178 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TO15178 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TO15178 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TO15178 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TO15178 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TO15178 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TO15178 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TO15178 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TO15178 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TO15178 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TO15178 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TO15178 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TO15178 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TO15178 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TO15178 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TO15178 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TO15178 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TO15178 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TO15178 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TO15178 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TO15178 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TO15178 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TO15178 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TO15178 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TO15178 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TO15178 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TO15178 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TO15178 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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