Protein–RNA interactions for Protein: M5A8F1

ERVH48-1, Suppressyn, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVH48-1M5A8F1 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVH48-1M5A8F1 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms