Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms