Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVV-2B6SEH9 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVV-2B6SEH9 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms