Protein–RNA interactions for Protein: A6NIR3

AGAP5, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP5A6NIR3 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
AGAP5A6NIR3 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.7 ms