Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y587

AP4S1, AP-4 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4S1Q9Y587 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP4S1Q9Y587 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms